全基因组甲基化（WGBS）
1 技术简介
全基因组重亚硫酸盐测序（Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS）是基于重亚硫酸盐处理的甲基化分析方法，首先通过重亚硫酸盐对样本DNA进行处理，将未甲基化的C碱基转化为U碱基，而甲基化的C碱基不会改变，进行PCR扩增后U碱基会变成T，与原本甲基化的C碱基区分开，再结合高通量测序技术，可绘制单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。技术优势有：可精确分析每一个C碱基的甲基化状态；可在全基因组水平上最大限度的获取完整的甲基化信息，精确绘制全基因组甲基化图谱；适用于所有具有参考基因组的物种，性价比高，相对于传统BSP或MSP方法费用少。
2 实验流程
3 生信分析流程
4 主要分析内容（部分）
DNA甲基化富集峰区域的在基因中的分布
差异DNA甲基化区的GO（Gene Ontology）与信号通路分析
差异甲基化基因的聚类分析
5 参考文献
[1]Auclair G, Guibert S, Bender A, etal. Ontogeny of CpG island methylation and specificity of DNMT3methyltransferases during embryonic development in the mouse[J]. Genomebiology, 2014, 15(12): 545.
[2]Heller G, Topakian T, Altenberger C,et al. Next-generation sequencing identifies major DNA methylation changesduring progression of Ph+ chronic myeloid leukemia[J]. Leukemia, 2016,30(9):1861-1868.
[3]Yan H, Bombarely A, Xu B, et al. siRNAsregulate DNA methylation and interfere with gene and lncRNA expression in theheterozygous polyploid switchgrass[J]. Biotechnology for Biofuels, 2018, 11(1):208.